More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0357 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  50.32 
 
 
787 aa  739    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  100 
 
 
752 aa  1534    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  53.56 
 
 
761 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  52.36 
 
 
762 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  51.92 
 
 
755 aa  751    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  54.53 
 
 
757 aa  771    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  88.3 
 
 
752 aa  1363    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  51.49 
 
 
746 aa  702    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  54.18 
 
 
724 aa  763    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  48.05 
 
 
738 aa  620  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  49.36 
 
 
737 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  49.5 
 
 
737 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  48.47 
 
 
737 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  47.27 
 
 
732 aa  582  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  45.29 
 
 
735 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  45.59 
 
 
733 aa  572  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  47.03 
 
 
728 aa  566  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  44.9 
 
 
732 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  44.9 
 
 
731 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  45.93 
 
 
707 aa  558  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  46.32 
 
 
648 aa  556  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  44.6 
 
 
743 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  47.19 
 
 
809 aa  554  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  44.05 
 
 
731 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  46.48 
 
 
729 aa  546  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  46.01 
 
 
727 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
758 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  43.85 
 
 
721 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  43.3 
 
 
731 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  42.68 
 
 
758 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  43.36 
 
 
749 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  35.69 
 
 
828 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  34.82 
 
 
838 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  32.78 
 
 
846 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  33.75 
 
 
794 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  30.69 
 
 
793 aa  387  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  34.1 
 
 
826 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.36 
 
 
798 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  34.02 
 
 
812 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  31.65 
 
 
799 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  31.65 
 
 
799 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  31.37 
 
 
799 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.8 
 
 
799 aa  382  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  31.79 
 
 
807 aa  382  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  31.56 
 
 
799 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.63 
 
 
795 aa  382  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  32.07 
 
 
803 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  32.74 
 
 
813 aa  378  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  34.21 
 
 
818 aa  378  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  31.65 
 
 
799 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  31.7 
 
 
799 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  31.65 
 
 
803 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  32.02 
 
 
803 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  30.86 
 
 
817 aa  367  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.5 
 
 
797 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  31.73 
 
 
807 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  30.81 
 
 
803 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  32.06 
 
 
797 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  33.74 
 
 
834 aa  363  6e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  32.4 
 
 
815 aa  363  7.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
814 aa  363  8e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  34.29 
 
 
765 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.91 
 
 
790 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  31.02 
 
 
796 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  29.42 
 
 
815 aa  356  8.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  32.37 
 
 
792 aa  356  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  31.08 
 
 
796 aa  355  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  30.93 
 
 
743 aa  355  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  31.76 
 
 
802 aa  355  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  32.83 
 
 
819 aa  355  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  31.76 
 
 
802 aa  355  2e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  30.59 
 
 
802 aa  354  4e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  32.65 
 
 
792 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  31.02 
 
 
792 aa  353  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  31.09 
 
 
798 aa  352  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  31.09 
 
 
798 aa  352  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  32.85 
 
 
790 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  28.3 
 
 
806 aa  350  4e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 
806 aa  350  8e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  30.57 
 
 
794 aa  348  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  30.96 
 
 
808 aa  348  3e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  32.19 
 
 
800 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  30.76 
 
 
791 aa  347  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  30.89 
 
 
791 aa  347  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  32.11 
 
 
732 aa  347  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  32.67 
 
 
793 aa  347  6e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  32.92 
 
 
741 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  32 
 
 
809 aa  345  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  30.62 
 
 
793 aa  345  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  30.25 
 
 
791 aa  344  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  31.87 
 
 
794 aa  344  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  31.42 
 
 
811 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  32 
 
 
732 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  29.41 
 
 
820 aa  343  8e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  29.92 
 
 
805 aa  343  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  30.72 
 
 
783 aa  342  1e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  31.98 
 
 
806 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  31.21 
 
 
792 aa  342  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  30.65 
 
 
787 aa  342  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  31.92 
 
 
860 aa  341  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>