More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2255 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  51.49 
 
 
752 aa  721    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  52.19 
 
 
762 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  52.22 
 
 
761 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  51.38 
 
 
787 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  50.95 
 
 
752 aa  729    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  57.6 
 
 
724 aa  739    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
746 aa  1479    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  55.2 
 
 
755 aa  723    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  53.06 
 
 
757 aa  679    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  47.03 
 
 
738 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  44.66 
 
 
735 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  45.9 
 
 
733 aa  547  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  47.52 
 
 
743 aa  545  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
731 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  43.9 
 
 
731 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  44.92 
 
 
732 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  49.37 
 
 
648 aa  530  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  45.23 
 
 
707 aa  519  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  46.71 
 
 
729 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  45.98 
 
 
727 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  46.5 
 
 
737 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  45.85 
 
 
728 aa  515  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  46.52 
 
 
737 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  46.36 
 
 
737 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  47.89 
 
 
809 aa  505  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  43.12 
 
 
732 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  44.6 
 
 
758 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  46.44 
 
 
749 aa  480  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  46.24 
 
 
758 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  43.89 
 
 
731 aa  472  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  43.87 
 
 
721 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  37.45 
 
 
826 aa  416  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  34.35 
 
 
828 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  37.03 
 
 
834 aa  395  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  38.08 
 
 
818 aa  395  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  36.29 
 
 
846 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  31.59 
 
 
793 aa  382  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  33.62 
 
 
803 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  33.76 
 
 
803 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  33.48 
 
 
803 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  33.57 
 
 
799 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
807 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.66 
 
 
812 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  33.43 
 
 
799 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  33.43 
 
 
799 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  34.87 
 
 
839 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  34.34 
 
 
838 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  32.69 
 
 
814 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  32.96 
 
 
799 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  34.49 
 
 
806 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  36.13 
 
 
811 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  33.05 
 
 
799 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  35.53 
 
 
811 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  32.7 
 
 
813 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  32.68 
 
 
793 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
787 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  36.2 
 
 
765 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  33.57 
 
 
797 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.31 
 
 
799 aa  364  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  33.38 
 
 
799 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
807 aa  363  8e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  32.18 
 
 
791 aa  362  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  30.14 
 
 
820 aa  361  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
819 aa  360  6e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.62 
 
 
790 aa  359  9e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  32.17 
 
 
808 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  30.17 
 
 
817 aa  359  9.999999999999999e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.89 
 
 
798 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  31.97 
 
 
791 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.95 
 
 
795 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  37.08 
 
 
800 aa  356  8.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  32.91 
 
 
797 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  32.02 
 
 
794 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  36.17 
 
 
824 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  32.66 
 
 
787 aa  355  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  30.83 
 
 
796 aa  353  5.9999999999999994e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  33.99 
 
 
806 aa  353  8e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  36.17 
 
 
882 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  33.47 
 
 
815 aa  351  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  30.11 
 
 
802 aa  351  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  35.89 
 
 
824 aa  351  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  34.48 
 
 
740 aa  350  6e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  33.57 
 
 
806 aa  350  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  34.91 
 
 
817 aa  350  7e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  28.59 
 
 
806 aa  348  1e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  32.17 
 
 
809 aa  346  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  35.15 
 
 
793 aa  344  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  31.89 
 
 
742 aa  343  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  35.49 
 
 
816 aa  343  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  35.15 
 
 
802 aa  343  7e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  31.77 
 
 
792 aa  342  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
823 aa  342  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  32.87 
 
 
789 aa  342  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  35.11 
 
 
748 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  32.14 
 
 
803 aa  341  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10093  cation transporter ATPase A ctpA  34.38 
 
 
761 aa  341  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  33.15 
 
 
791 aa  340  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  34.01 
 
 
799 aa  340  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  33.88 
 
 
800 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  34.75 
 
 
741 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>