156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_A04 on replicon NC_008496
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008496  LEUM_A04  copper chaperone  100 
 
 
78 aa  157  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1043  hypothetical protein  56.76 
 
 
75 aa  77.8  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000664853  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0982  copper chaperone  43.42 
 
 
76 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1427  heavy metal transport/detoxification protein  46.05 
 
 
78 aa  62.8  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  41.1 
 
 
797 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  36 
 
 
815 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
471 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  38.46 
 
 
799 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  31.58 
 
 
836 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  33.8 
 
 
806 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  40.28 
 
 
821 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  33.8 
 
 
806 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  32.88 
 
 
806 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  33.8 
 
 
805 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  32.88 
 
 
805 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  32.88 
 
 
805 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  32.88 
 
 
805 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  32.88 
 
 
805 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  32.88 
 
 
805 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  37.5 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  37.5 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  33.8 
 
 
805 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
818 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
836 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
814 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  32.84 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
976 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
768 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
759 aa  47.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  34.25 
 
 
750 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  43.94 
 
 
742 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  31.34 
 
 
68 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  43.94 
 
 
740 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  39.68 
 
 
954 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  35.82 
 
 
742 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  32.84 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  32.26 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  30.26 
 
 
889 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  30.26 
 
 
889 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10677  P1B, P type ATPase  31.43 
 
 
883 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.704376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
743 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  31.51 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  32.05 
 
 
797 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  37.68 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  37.68 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  37.68 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
752 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  37.68 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
866 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  31.43 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  30.99 
 
 
802 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  33.85 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  30.43 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  37.68 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  37.68 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  37.68 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  37.68 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2338  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
79 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
849 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  37.68 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  34.33 
 
 
79 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  37.68 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
751 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  33.85 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  33.8 
 
 
820 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  32.39 
 
 
855 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1663  heavy metal transport/detoxification protein  32.84 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  28.77 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  34.25 
 
 
828 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  33.82 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  30.99 
 
 
816 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  31.43 
 
 
795 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  35.82 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0689  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 
694 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1338  heavy metal-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  36.36 
 
 
724 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
942 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  34.38 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1003  heavy metal translocating P-type ATPase  29.17 
 
 
807 aa  42.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  34.38 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  31.43 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  31.43 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  31.82 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01515  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  37.1 
 
 
689 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  31.34 
 
 
739 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.94 
 
 
799 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  27.54 
 
 
857 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  31.25 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  31.88 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  32.39 
 
 
786 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  29.85 
 
 
835 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  32.81 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
759 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
748 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
837 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
759 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>