200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4313 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  100 
 
 		 91 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  78.02 
 
 		 95 aa  147  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  87.91 
 
 		 91 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  61.11 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  66.67 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  53.93 
 
 		 94 aa  104  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  52.27 
 
 		 98 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  57.61 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  64.29 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  64.29 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  64.29 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  64.29 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  64.29 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  64.29 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  64.56 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  54.02 
 
 		 100 aa  95.9  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  58.11 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  62.86 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  62.86 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  62.86 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  64.29 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  52.69 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  64.29 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  64.29 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  61.43 
 
 		 91 aa  91.3  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  61.43 
 
 		 91 aa  91.3  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  55.06 
 
 		 94 aa  90.9  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  50.55 
 
 		 91 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  52.17 
 
 		 94 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  61.43 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  52.81 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  57.97 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  46.51 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  47.06 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  54.67 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  43.18 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  48.57 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  47.83 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  52.22 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  47.46 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  41.11 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  39.77 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  39.68 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 816 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0117  mercuric transport protein periplasmic component  38.89 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  41.57 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 838 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  37.7 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 820 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  37.5 
 
 		 954 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 758 aa  51.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  31.43 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 871 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 1071 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 818 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  37.5 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  35 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 699 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 		 1087 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  40.62 
 
 		 833 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 753 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  32.86 
 
 		 752 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 758 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  47.62 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1305  Heavy metal transport/detoxification protein  33.71 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.921756 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 837 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 857 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 821 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  33.71 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 887 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1680  Heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0959  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 761 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 758 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3215  heavy metal transport/detoxification protein  33.71 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.501127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 805 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 826 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  30.88 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 759 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  29.41 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 759 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 866 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  30.56 
 
 		 797 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 867 aa  45.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 861 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  30.65 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  40.98 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 826 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 821 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3072  heavy metal transport/detoxification protein  33.71 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3641  heavy metal transport/detoxification protein  29.89 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>