230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0169 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  100 
 
 
91 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  76.92 
 
 
95 aa  144  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  87.91 
 
 
91 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  66.67 
 
 
94 aa  110  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  59.57 
 
 
98 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  57.14 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  51.69 
 
 
94 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  57.14 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  57.14 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  57.14 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  57.14 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  57.14 
 
 
91 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  55.17 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  53.85 
 
 
91 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  54.95 
 
 
91 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  56.04 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  55.43 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  63.29 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  54.95 
 
 
91 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  58.9 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  54.95 
 
 
91 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  54.95 
 
 
91 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  64.79 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  64.79 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  55.06 
 
 
94 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  62.86 
 
 
90 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  51.65 
 
 
91 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  51.72 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  56.18 
 
 
94 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  54.95 
 
 
91 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  51.09 
 
 
94 aa  90.5  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  59.42 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  49.41 
 
 
94 aa  84.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  51.43 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  50.54 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  42.22 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  43.21 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  47.14 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  41.98 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  52.54 
 
 
61 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  51.11 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  45.21 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  43.33 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 
816 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  38.1 
 
 
71 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0117  mercuric transport protein periplasmic component  36.67 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 
820 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  35 
 
 
954 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  39.34 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
1087 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 
838 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
758 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
758 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  39.13 
 
 
833 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
1071 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
818 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
826 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  36.67 
 
 
68 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  39.06 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  42.03 
 
 
209 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 
699 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  35.96 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  39.68 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  39.06 
 
 
68 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  34.43 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  34.43 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
837 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  30.69 
 
 
797 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
857 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
826 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1305  Heavy metal transport/detoxification protein  34.83 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.921756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  32.86 
 
 
752 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  36 
 
 
821 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
759 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
759 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  37.5 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
887 aa  47.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
753 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0959  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
761 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
821 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
871 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3215  heavy metal transport/detoxification protein  34.83 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.501127  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1212  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
78 aa  47  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
861 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  46.03 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  34.78 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3072  heavy metal transport/detoxification protein  34.83 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
867 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  38.71 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
866 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6226  Heavy metal transport/detoxification protein  30.11 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
805 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  36.07 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  31.82 
 
 
805 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  31.82 
 
 
805 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  30.88 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  31.82 
 
 
805 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  31.82 
 
 
805 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>