75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1945 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  100 
 
 		 112 aa  228  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  44.83 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  54.05 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  54.05 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  46.67 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  43.33 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  54.05 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  50 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  44.44 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  40.21 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  46.67 
 
 		 91 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  43.33 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  44.44 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  44.44 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  44.44 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  44.44 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  52.86 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  52.86 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  48.57 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  45.78 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  44.44 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  40.91 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  47.14 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  47.95 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  50.72 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  51.35 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  39.6 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  46.25 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  43.66 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  37.8 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  35.23 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  42.86 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  46.97 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  47.3 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  37.18 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  42.65 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  37.84 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  44.07 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  32.94 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0117  mercuric transport protein periplasmic component  35.29 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  42.42 
 
 		 817 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 1071 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.89 
 
 		 855 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 835 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  36.51 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  34.15 
 
 		 816 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 926 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2126  Heavy metal transport/detoxification protein  33.8 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 762 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  37.68 
 
 		 228 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 767 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 762 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 762 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 762 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  33.78 
 
 		 740 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 804 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  35.82 
 
 		 955 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  35.82 
 
 		 961 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  37.84 
 
 		 1040 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  41.79 
 
 		 819 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 836 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.76 
 
 		 473 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 836 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 737 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 785 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2844  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 68 aa  40  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 812 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  40.74 
 
 		 826 aa  40  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  44.68 
 
 		 125 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>