More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1476 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  100 
 
 		 94 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  81.91 
 
 		 94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  61.8 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  54.26 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  61.11 
 
 		 92 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  60.67 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  66.29 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  66.29 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  62.92 
 
 		 91 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  64.04 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  55.56 
 
 		 98 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  62.92 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  60.67 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  54.55 
 
 		 98 aa  100  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  61.8 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  61.8 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  61.8 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  61.8 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  61.8 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  61.8 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  56.18 
 
 		 100 aa  98.2  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  62.32 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  62.32 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  61.76 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  56.18 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  52.81 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  51.69 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  52.81 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  51.85 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  53.42 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  50 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  46.59 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  44.58 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  41.86 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  39.77 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  52.54 
 
 		 61 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  38.64 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  50 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  43.96 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  39.13 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  39.02 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  43.75 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  46.97 
 
 		 1087 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  37.08 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  37.5 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 762 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  35.38 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 		 767 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  39.68 
 
 		 954 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 872 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 816 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  46.03 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  37.33 
 
 		 837 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0959  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 761 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1442  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 791 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.153784  normal  0.0826398 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  35.29 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2086  heavy metal translocating P-type ATPase  42.25 
 
 		 744 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 855 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  40.51 
 
 		 955 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 		 755 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  33.82 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  41.18 
 
 		 209 aa  50.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004188  copper-translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 909 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 818 aa  50.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  40.51 
 
 		 961 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 834 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 		 782 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  36.92 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1058  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 754 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 826 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  38.67 
 
 		 869 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 		 782 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  34.25 
 
 		 823 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 821 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 757 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 759 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  33.82 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 938 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.68 
 
 		 833 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  42.03 
 
 		 813 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 1071 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 759 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  42.86 
 
 		 955 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 885 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 861 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 835 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  34.57 
 
 		 868 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 820 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  36.62 
 
 		 795 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 835 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>