More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1666 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  100 
 
 		 73 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  52.05 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  52.11 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  45.07 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 68 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  37.5 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  38.57 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 839 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  43.48 
 
 		 1182 aa  61.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  37.14 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  37.14 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  35.71 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  37.14 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  37.14 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  37.14 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  37.14 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  37.14 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  37.14 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 797 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  36.62 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  39.71 
 
 		 1196 aa  59.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  40.91 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 		 887 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 748 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 798 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  43.55 
 
 		 954 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  34.29 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 818 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  34.29 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 803 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  36.76 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 798 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 798 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  34.78 
 
 		 833 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 794 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  48.28 
 
 		 827 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  32.86 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  31.43 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 820 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  39.19 
 
 		 837 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  35.29 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 814 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 723 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  37.31 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  42.03 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  41.94 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 838 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 827 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  41.79 
 
 		 826 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 826 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 759 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 759 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  37.5 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 1061 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 1063 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 1061 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  37.7 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 1061 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  43.28 
 
 		 1063 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 744 aa  53.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 841 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  43.28 
 
 		 1061 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 78 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03117  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  39.06 
 
 		 1211 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.208489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  32.35 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  37.7 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0413  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 723 aa  52  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  32.84 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 		 758 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 836 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  36.23 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  37.7 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  36.92 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 1087 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  38.46 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 816 aa  51.6  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 		 471 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 837 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 890 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 855 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  36.36 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 723 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  33.82 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>