More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1638 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  100 
 
 		 74 aa  144  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  95.95 
 
 		 74 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  52.05 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  38.57 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  35.21 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  36.62 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  36.62 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  36.62 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  36.62 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  36.62 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  36.62 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  34.72 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  33.8 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  36.23 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  33.8 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  34.29 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  35.62 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  33.8 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  33.8 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  37.7 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  33.33 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  33.33 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  36.99 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  37.84 
 
 		 742 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  35 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03117  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  40.62 
 
 		 1211 aa  57  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.208489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  37.1 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  34.92 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  35.21 
 
 		 744 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  40 
 
 		 1196 aa  56.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 67 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  33.87 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  33.87 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  32.79 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  31.15 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  31.15 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 759 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  31.15 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 759 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 759 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  36.62 
 
 		 833 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  34.25 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  32.39 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  38.24 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  32.5 
 
 		 209 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 871 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 723 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  29.41 
 
 		 758 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  32.86 
 
 		 752 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  37.88 
 
 		 954 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 835 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  34.43 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 938 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 802 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  35.29 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  34.33 
 
 		 1182 aa  50.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 827 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  34.78 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 837 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  29.69 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 925 aa  50.4  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 826 aa  50.1  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  30.16 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  34.29 
 
 		 753 aa  50.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  30.88 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 750 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  30.88 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 820 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2277  heavy metal transport/detoxification protein  39.29 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.938593  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 861 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  29.41 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 827 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  29.41 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 837 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  31.43 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  31.15 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 744 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  36.36 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 		 838 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  30.88 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  28.79 
 
 		 889 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  28.79 
 
 		 889 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  34.29 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  29.58 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 1087 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>