266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0823 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 83 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  72.31 
 
 		 65 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  67.69 
 
 		 65 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  67.69 
 
 		 65 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  63.49 
 
 		 65 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  56.92 
 
 		 65 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  58.46 
 
 		 65 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  56.92 
 
 		 65 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  58.33 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  54.39 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  53.45 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  59.65 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  51.72 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  47.54 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  56.14 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  56.14 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  37.04 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  48.33 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  43.33 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  46.67 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 77 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  36.9 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  49.06 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  49.06 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  40.98 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  41.54 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  38.03 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  40.98 
 
 		 724 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  41.38 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  37.29 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  38.03 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  32.88 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  40.32 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  34.78 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  34.85 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 894 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2448  heavy metal-binding protein, putative  40.68 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2074  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  40 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>