More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1882 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  100 
 
 
68 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  85.07 
 
 
68 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  42.65 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  42.65 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  42.65 
 
 
69 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  46.67 
 
 
954 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  45.45 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  44.44 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  47.06 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 
68 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  37.7 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  37.7 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 
942 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  37.7 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  37.7 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  37.7 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  37.7 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  39.34 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
841 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  40.98 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  39.39 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  41.67 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
832 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  36.51 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
82 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
867 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  36.92 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  39.13 
 
 
837 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
827 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  36.51 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
889 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  36.67 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  37.88 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  40 
 
 
819 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 
836 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  35 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
836 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
824 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
832 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.35 
 
 
889 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  38.71 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  46.67 
 
 
826 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  31.75 
 
 
816 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
835 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  37.1 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
836 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  34.43 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  34.78 
 
 
833 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
839 aa  53.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  47.54 
 
 
838 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
789 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
815 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  38.1 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
857 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
830 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
757 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
762 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
795 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  35.38 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 
838 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  35.38 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
835 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  34.85 
 
 
742 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  35.38 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
795 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
849 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  45.9 
 
 
894 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
762 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
759 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
767 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
762 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  31.82 
 
 
91 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  33.33 
 
 
94 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  36.36 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
762 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
1087 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  36.07 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
837 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
861 aa  50.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
758 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
976 aa  50.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  34.43 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
835 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
806 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
839 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 
827 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
833 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 
826 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
871 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
798 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
798 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  30.16 
 
 
74 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>