209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0968 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
66 aa  137  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
976 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  38.71 
 
 
68 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  39.71 
 
 
68 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  40 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
744 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  34.48 
 
 
70 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
835 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
832 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  35 
 
 
817 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  38.71 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  42.62 
 
 
799 aa  50.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 
813 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
802 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1150  heavy metal transport/detoxification protein  37.04 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455128  hitchhiker  0.000000264701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 
946 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 
937 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
832 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
802 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  32.79 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  33.87 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
825 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  38.71 
 
 
1196 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
834 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
74 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  37.31 
 
 
74 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  31.15 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
732 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  28.33 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  30.51 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2074  Heavy metal transport/detoxification protein  51.35 
 
 
68 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  30.51 
 
 
69 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2448  heavy metal-binding protein, putative  51.35 
 
 
68 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
889 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  36.76 
 
 
805 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  36.76 
 
 
805 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  36.76 
 
 
805 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
732 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  36.76 
 
 
805 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2277  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.938593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
757 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  32.31 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  36.76 
 
 
805 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 
821 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  32.26 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
826 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
827 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
856 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  37.93 
 
 
805 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 
836 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
1021 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  32.31 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  39.34 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
1021 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
830 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  30 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  30.77 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  30.16 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03117  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  39.34 
 
 
1211 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.208489  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
817 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  30.51 
 
 
1040 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2375  heavy metal-binding domain-containing protein  25.76 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00029773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
806 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
857 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  29.82 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 
835 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  31.03 
 
 
751 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
889 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  31.67 
 
 
748 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
782 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  31.75 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  31.15 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
894 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  31.15 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 
797 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
782 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  31.75 
 
 
804 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28495  copper-transporting P-type ATPase  33.87 
 
 
804 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105447  normal  0.5687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  28.81 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  32.81 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  32.81 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  35.29 
 
 
805 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  33.82 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
1013 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 
839 aa  44.7  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  28.81 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>