More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3947 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
67 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
67 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
67 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  55.38 
 
 
827 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  55.38 
 
 
826 aa  64.7  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
767 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
762 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
762 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
762 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  55 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
762 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
852 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 
835 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  51.56 
 
 
70 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  48.44 
 
 
840 aa  58.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  43.08 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  47.54 
 
 
1196 aa  58.2  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
790 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  43.08 
 
 
792 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
827 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  43.94 
 
 
819 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  44.62 
 
 
792 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
68 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
833 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  44.78 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  53.33 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  52.38 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
855 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  44.12 
 
 
841 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
69 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  41.79 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  50 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
913 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  50 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  50 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  46.03 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  46.97 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  46.97 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  46.97 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  46.97 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  46.97 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
839 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  40 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  46.97 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
856 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  44.12 
 
 
833 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  49.12 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3259  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
884 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  47.37 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
100 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  43.48 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
829 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2186  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  40.3 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
65 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3027  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
939 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  50.79 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
68 aa  53.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  45.45 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
64 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  38.71 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
745 aa  52.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 
70 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  40.91 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  43.55 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  40.91 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 
65 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  39.39 
 
 
67 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
841 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
832 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
804 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
832 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>