235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3747 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 69 aa  137  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  65.08 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  57.58 
 
 		 69 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  56.25 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  59.15 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 		 69 aa  70.1  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  56.06 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  56.34 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 		 71 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  52.94 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  55.74 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  54.1 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  52.86 
 
 		 80 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  54.39 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  52.17 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  52.86 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  49.21 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  47.22 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  49.3 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  49.25 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  52.38 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  50.79 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  47.14 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 69 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  46.15 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  42.42 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  41.94 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  56.36 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 791 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  45.9 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  45.16 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  43.94 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  50 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  46.27 
 
 		 67 aa  52  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  45.9 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  45.76 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  44.93 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  48.21 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 859 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  38.98 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  40.98 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  40.85 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  41.54 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 75 aa  48.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 789 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>