199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



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Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  100 
 
 
65 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  96.92 
 
 
65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  75 
 
 
65 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  67.69 
 
 
83 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  66.15 
 
 
65 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  66.15 
 
 
65 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  64.62 
 
 
65 aa  87  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  63.08 
 
 
65 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  55.38 
 
 
65 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 
65 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  63.08 
 
 
65 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  56.14 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  54.39 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  54.39 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
63 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
63 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  54.1 
 
 
69 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  52.63 
 
 
69 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  53.45 
 
 
64 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  48.33 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  49.12 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  46.67 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  49.15 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  45.9 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 
64 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  44.07 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  45.9 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  42.37 
 
 
66 aa  53.9  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  41.67 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
894 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 
69 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
66 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.26 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  45 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  50.94 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  50.94 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 
65 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  44.26 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  40 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  41.27 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 
65 aa  48.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  55.56 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
66 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  38.33 
 
 
67 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
976 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0557  heavy metal transport/detoxification protein  42.31 
 
 
56 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
68 aa  47.4  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  38.46 
 
 
209 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  42.62 
 
 
109 aa  47  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2074  Heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 
68 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2448  heavy metal-binding protein, putative  42.11 
 
 
68 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0030  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
63 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.962189  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0028  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
63 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
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NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
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