93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1877 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 65 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 65 aa  57  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  41.18 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  42.86 
 
 		 68 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  34.43 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  38.71 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  35.48 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  35.48 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  39.34 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  39.34 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  34.92 
 
 		 561 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  33.33 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  34.92 
 
 		 561 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  40.32 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 839 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  34.43 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  35.48 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  38.3 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  35 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  27.42 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  37.1 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  37.7 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  38.71 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 889 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 833 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 821 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 872 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  34.55 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  33.87 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 730 aa  43.5  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  47.83 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 74 aa  42.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 		 1182 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  37.88 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 797 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  36.23 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  40.82 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 70 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 67 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  31.75 
 
 		 889 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  29.51 
 
 		 1196 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  33.87 
 
 		 561 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  33.87 
 
 		 67 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 		 894 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  31.67 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 841 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 833 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 867 aa  41.2  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  31.25 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  27.87 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  32.39 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 891 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  30.65 
 
 		 561 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2891  putative copper chaperone  32.31 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  30 
 
 		 905 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1537  heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.330529  normal  0.80617 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  33.87 
 
 		 810 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0593  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 		 711 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.483135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  25.4 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  33.96 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 856 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  27.87 
 
 		 68 aa  40  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 70 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>