258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36750 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  67.69 
 
 		 68 aa  84.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  60.61 
 
 		 68 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  62.12 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 		 68 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  59.09 
 
 		 70 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  57.58 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  53.03 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  59.02 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  53.12 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  56.67 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  61.82 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  55.93 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  51.61 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  56.92 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  53.97 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  59.65 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  54.24 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  50.79 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  59.57 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 720 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  54 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 726 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  56.67 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  39.34 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  53.23 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  32.81 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 833 aa  53.9  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  35.48 
 
 		 751 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  45.71 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  32.81 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  41.38 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 818 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  42.62 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 891 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 802 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  52.17 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  40.68 
 
 		 74 aa  50.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 		 835 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  38.98 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  48.53 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  30.77 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  32.81 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  47.54 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 894 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  29.69 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  45.31 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  51.22 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 976 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  40.91 
 
 		 541 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  36.92 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 730 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 196 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0610  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 719 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.424082  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0891  copper/potassium-transporting ATPase  31.25 
 
 		 720 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0213981  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 814 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  39.34 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>