141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6127 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 74 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  55.07 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  56.92 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  61.29 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  60.66 
 
 		 68 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  59.09 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  59.68 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  58.33 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 		 71 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  53.85 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  55 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  52.17 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  54.84 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  56.9 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  50 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  50.79 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 73 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  57.58 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  51.39 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  53.23 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  54.39 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  47.54 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  44.93 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  56.06 
 
 		 72 aa  52  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 65 aa  50.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  43.55 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  44.44 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0131  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  41.54 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  46.05 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  46.05 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  47.14 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 976 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  45.59 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  32.81 
 
 		 1196 aa  47.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  43.64 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  35.38 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  43.64 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  35 
 
 		 810 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 802 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3259  heavy metal translocating P-type ATPase  44.83 
 
 		 884 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48196  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12930  copper chaperone  33.85 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  42.86 
 
 		 954 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 		 793 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 794 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 926 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  44.26 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  44.26 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  32.86 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  37.1 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  35.48 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  38.81 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  40 
 
 		 803 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>