284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0018 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
70 aa  135  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  64.71 
 
 
68 aa  87.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  65.67 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  63.08 
 
 
71 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  57.58 
 
 
68 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  58.21 
 
 
68 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  67.19 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  60.94 
 
 
70 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  62.12 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 
68 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  67.16 
 
 
69 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  65.67 
 
 
67 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 
69 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  62.12 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  51.47 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  57.81 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  57.14 
 
 
71 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  56.06 
 
 
70 aa  67  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  51.61 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  55.93 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  56.14 
 
 
70 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  48.48 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  52.17 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 
70 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3701  copper-translocating P-type ATPase  74.29 
 
 
70 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.754516  normal  0.0828081 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  44.78 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
69 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 
80 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 
80 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  50.72 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 
108 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  50.72 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  50 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
73 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
69 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  41.79 
 
 
68 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  41.79 
 
 
68 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
80 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  55.22 
 
 
72 aa  56.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  56.06 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
117 aa  57  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  50 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  50 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  49.18 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  44.78 
 
 
68 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
65 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
74 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
1182 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  40 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  40.58 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  46.55 
 
 
827 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  49.18 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  48.33 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  43.28 
 
 
68 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  43.28 
 
 
68 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  43.28 
 
 
68 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  43.28 
 
 
68 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  43.28 
 
 
68 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  41.79 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  44.26 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
841 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  47.89 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  41.54 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  41.54 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
804 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  41.79 
 
 
68 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  41.79 
 
 
68 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  45.45 
 
 
541 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  41.79 
 
 
68 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
839 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.08 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
1061 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  46.03 
 
 
1063 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
1061 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  40.98 
 
 
817 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
1063 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>