218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0588 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 65 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  93.85 
 
 		 65 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  95.38 
 
 		 65 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  83.08 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  63.08 
 
 		 65 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 		 65 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  66.15 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  66.15 
 
 		 65 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  63.08 
 
 		 65 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  58.46 
 
 		 83 aa  84  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  63.93 
 
 		 65 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  51.67 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  52.63 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  53.45 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  47.54 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  51.72 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  44.07 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  50.88 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  50.88 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  40.98 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  45.9 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  52.83 
 
 		 70 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  52.83 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  37.29 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  44.26 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  41.94 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  41.94 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  41.38 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  40.98 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3497  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 62 aa  50.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.26 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  38.71 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  45 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  38.71 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0557  heavy metal transport/detoxification protein  44.23 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  40 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  36.67 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  40 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>