294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5745 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
68 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  68.18 
 
 
68 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  69.12 
 
 
70 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  62.69 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  63.64 
 
 
68 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  62.12 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 
71 aa  80.1  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  56.06 
 
 
68 aa  79.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  65.15 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  65.15 
 
 
66 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 
68 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  66.67 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  55.88 
 
 
68 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  65.08 
 
 
68 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  60.87 
 
 
76 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 
77 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  56.06 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  64.71 
 
 
69 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  56.06 
 
 
67 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  57.58 
 
 
69 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 
70 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  65.71 
 
 
72 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  56.34 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  61.54 
 
 
75 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  59.02 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  61.76 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 
70 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 
69 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  56.76 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  54.93 
 
 
73 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  51.47 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 
69 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  52.31 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  51.47 
 
 
76 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  52.24 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
73 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 
79 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  53.97 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
76 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 
70 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 
75 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  50 
 
 
71 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  45.16 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 
73 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  52.46 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  58.46 
 
 
74 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
65 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 
67 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  48.53 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  43.94 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 
814 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  50.77 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  49.23 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  42.42 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  42.42 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  47.62 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
69 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  44.93 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  35.94 
 
 
71 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  46.97 
 
 
67 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
852 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  45.9 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
76 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  39.06 
 
 
74 aa  50.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
726 aa  50.4  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  44.78 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  44.07 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
832 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
891 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
872 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  42.37 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  43.08 
 
 
68 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  36.76 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  36.76 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
790 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  34.92 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
720 aa  47.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  37.5 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  42.86 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>