256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5838 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
69 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  56.25 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  55.38 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  59.68 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  53.52 
 
 
73 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
71 aa  68.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  54.24 
 
 
68 aa  67  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 
70 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  54.29 
 
 
74 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 
73 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 
68 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  53.23 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  53.97 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  55.07 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  55.74 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  55.74 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  55.56 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  55.88 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
70 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
70 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  54.1 
 
 
108 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  55.74 
 
 
68 aa  60.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  51.61 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  54.39 
 
 
68 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  38.46 
 
 
69 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  44.78 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  49.23 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  55.56 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  55.56 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
70 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
65 aa  52.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  35.94 
 
 
1196 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  40.62 
 
 
67 aa  52  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  39.39 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  40.62 
 
 
67 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.75 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
79 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 
734 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  42.19 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  42.19 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
65 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  43.64 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  40 
 
 
792 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0383  heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
65 aa  48.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  39.68 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  42.03 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
839 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3259  heavy metal translocating P-type ATPase  46.55 
 
 
884 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  37.7 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0080  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  43.75 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 
800 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 
67 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 
69 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  52.24 
 
 
72 aa  47  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 
69 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  36.67 
 
 
792 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  43.08 
 
 
764 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>