216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1468 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
113 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
70 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  77.14 
 
 
70 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  77.14 
 
 
70 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  76.81 
 
 
115 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  68.12 
 
 
69 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  68.66 
 
 
69 aa  92  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  66.67 
 
 
71 aa  91.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  59.42 
 
 
69 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  60.61 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 
68 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 
69 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  54.69 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  51.61 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  46.27 
 
 
68 aa  63.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  50.77 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  47.76 
 
 
69 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  59.38 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  52.73 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  43.94 
 
 
67 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  43.94 
 
 
67 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
67 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  43.66 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
70 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  49.25 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  53.85 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  48.53 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 
69 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
74 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  35.71 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  45.31 
 
 
67 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
76 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
73 aa  51.6  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
74 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  41.79 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
65 aa  50.8  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0610  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
719 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.424082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  40.62 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
75 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  39.13 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  39.39 
 
 
68 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 
66 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  41.27 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  43.08 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  40 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
720 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 
65 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  37.31 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  42.19 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
726 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  47.14 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  42.62 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  37.68 
 
 
73 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  38.46 
 
 
91 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  38.46 
 
 
91 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  38.46 
 
 
91 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  38.46 
 
 
91 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  38.46 
 
 
91 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
68 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
75 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  38.46 
 
 
91 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 
117 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  39.06 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12930  copper chaperone  29.85 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  30.88 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2844  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  38.46 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  45.31 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0891  copper/potassium-transporting ATPase  31.34 
 
 
720 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0213981  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  38.46 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
730 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  45.31 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
837 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  31.82 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 
70 aa  45.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  36.92 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
833 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
833 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>