More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1695 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 69 aa  131  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  86.57 
 
 		 69 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  70.15 
 
 		 71 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  68.18 
 
 		 66 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  63.64 
 
 		 68 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  60.87 
 
 		 69 aa  83.6  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  63.77 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  67.16 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  61.76 
 
 		 70 aa  80.9  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 		 68 aa  80.9  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  59.09 
 
 		 68 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  58.21 
 
 		 68 aa  80.1  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  70.31 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  64.06 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  70.59 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  55.07 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  59.15 
 
 		 74 aa  73.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  62.5 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 		 70 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  52.94 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  57.89 
 
 		 70 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  64.71 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  61.67 
 
 		 77 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  56.52 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  57.38 
 
 		 74 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  60.94 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 68 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  56.25 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  53.62 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  52.94 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  58.73 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  60.61 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  59.38 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  59.09 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  53.52 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  51.56 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  63.24 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  51.52 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  44.29 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3701  copper-translocating P-type ATPase  72.73 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.754516  normal  0.0828081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 852 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  45.83 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  43.55 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  47.76 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  50.88 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  53.62 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  45 
 
 		 77 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 		 804 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  48.21 
 
 		 1182 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 855 aa  50.8  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  61.11 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  41.54 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  49.09 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 762 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 762 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  38.81 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 762 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 767 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  41.18 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  42.86 
 
 		 954 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 835 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 790 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  44.07 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>