224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3704 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  191  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  93.55 
 
 		 93 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  64.52 
 
 		 66 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  57.75 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  62.12 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  60.34 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  58.73 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  56.45 
 
 		 71 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  53.03 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  58.06 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  59.68 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  56.25 
 
 		 69 aa  63.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  56.67 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  63.93 
 
 		 67 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  56.67 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  54.1 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  59.68 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  50.79 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  53.33 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  48.61 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  48.61 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  61.7 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  48.53 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  51.67 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  54.1 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  48.53 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  36.9 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  57.38 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  45.33 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  64.1 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  42.19 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  54.39 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  46.43 
 
 		 70 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  40.24 
 
 		 728 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  38.33 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  46.67 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  47.54 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  43.1 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  47.54 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 762 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  44.64 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  46.55 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  36.99 
 
 		 726 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  37.93 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 		 720 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  38.33 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 804 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  36.67 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0876  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 		 750 aa  45.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  44.26 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 762 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 894 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1545  copper chaperone  34.38 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3701  copper-translocating P-type ATPase  73.91 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.754516  normal  0.0828081 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 762 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  39.76 
 
 		 1182 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 762 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  37.93 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  39.66 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  37.93 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  40.54 
 
 		 841 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  37.93 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  49.09 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>