175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1741 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 73 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  69.01 
 
 		 74 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  63.38 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  60.27 
 
 		 73 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  61.19 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  63.24 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  59.42 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  61.97 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  59.42 
 
 		 69 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 		 68 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  59.7 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  55.07 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  56.16 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  55.71 
 
 		 71 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  55.07 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  55.88 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  53.62 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  52.24 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  52.17 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  60.61 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  52.11 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  53.52 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  50.68 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  59.09 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  56.34 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 		 80 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  49.23 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  57.35 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  50.72 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  47.89 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  50.72 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  47.76 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  50 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  62.5 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  50.77 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  49.23 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  47.62 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  50 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  49.28 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  56.52 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  51.61 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  53.62 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  43.28 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  51.72 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0963  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  34.72 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  42.65 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  42.65 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  43.48 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  41.43 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  37.31 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 762 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 841 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  52 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  39.44 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 65 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  40 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  40.91 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1877  heavy metal transport/detoxification protein  33.82 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.186242  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  29.58 
 
 		 739 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  40 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  40 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>