295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3354 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 66 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  68.18 
 
 		 68 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  69.23 
 
 		 67 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  66.13 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  66.67 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  64.52 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  57.58 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 		 69 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  57.58 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  60.94 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  68.18 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  57.58 
 
 		 69 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  59.7 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  57.38 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  59.09 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  63.16 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  55.56 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  57.58 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  68.09 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  60.66 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  56.92 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  57.63 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  65.15 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  50.91 
 
 		 826 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  44.62 
 
 		 742 aa  53.9  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  51.56 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  51.56 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  53.7 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  44.07 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3701  copper-translocating P-type ATPase  78.43 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.754516  normal  0.0828081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  46.55 
 
 		 560 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  46.55 
 
 		 976 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  41.43 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  49.09 
 
 		 827 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0593  heavy metal translocating P-type ATPase  49.15 
 
 		 711 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.483135  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 827 aa  50.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  43.33 
 
 		 817 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  46.3 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 827 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  44.64 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 840 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  44.26 
 
 		 1196 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  44.62 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  44.07 
 
 		 826 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.44 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  43.33 
 
 		 751 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  42.03 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  38.1 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 790 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  42.62 
 
 		 792 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 740 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 720 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 762 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 762 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 762 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  44.26 
 
 		 792 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  43.1 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 745 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 767 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  40.91 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>