83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1545 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1545  copper chaperone  100 
 
 
67 aa  134  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0386  copper-transporter protein CopZ  55.22 
 
 
68 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
833 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
69 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
68 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  53.85 
 
 
839 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  50 
 
 
835 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  36.92 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  45.83 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  35.94 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  47.73 
 
 
75 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 
69 aa  47.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  34.38 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
69 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  42.55 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  30.16 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  33.82 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  48.78 
 
 
70 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  42.22 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  43.18 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  34.38 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  30.16 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  30.16 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  34.33 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  47.62 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  48.84 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
762 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  37.5 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0879  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 
762 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.573666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  40.43 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 
65 aa  43.5  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 
867 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  41.86 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  51.22 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  36.36 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  36.36 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  45.24 
 
 
108 aa  42  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 
827 aa  42  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  32.76 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  46.51 
 
 
826 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  51.43 
 
 
76 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  51.22 
 
 
69 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  36.23 
 
 
942 aa  41.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  36.54 
 
 
82 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  35.94 
 
 
100 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 
65 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  43.9 
 
 
77 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  47.73 
 
 
69 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  44.19 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2277  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 
59 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.938593  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1892  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  37.74 
 
 
125 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
755 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  28.12 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  32.69 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  40 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  48.65 
 
 
551 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  47.5 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  51.43 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  36.73 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0423  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 
793 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3006  copper-translocating P-type ATPase  41.03 
 
 
850 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  33.33 
 
 
70 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  38.64 
 
 
925 aa  40  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>