35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1892 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1892  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 71 aa  137  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  52.94 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  38.71 
 
 		 728 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 1061 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 1061 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  43.33 
 
 		 1063 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 1063 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 1061 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 71 aa  43.9  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  43.33 
 
 		 1061 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 		 814 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  40.58 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 67 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 64 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 133 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  42.59 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  37.31 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1545  copper chaperone  35.94 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  40 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  46.27 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  38.33 
 
 		 65 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 70 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>