120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2298 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  100 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  87.5 
 
 		 65 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  66.15 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  66.15 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  66.15 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  66.15 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  64.62 
 
 		 66 aa  90.5  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  65.62 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  63.08 
 
 		 66 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  53.97 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  50.79 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  50.79 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  46.77 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  47.54 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  43.86 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  43.64 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  48.28 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  42.37 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  45.76 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  45.9 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  45.76 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0557  heavy metal transport/detoxification protein  48.08 
 
 		 56 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  44.26 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  35.94 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  35.94 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  35.94 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  35.94 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  34.38 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  42.11 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  43.86 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  40.62 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 937 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 946 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3404  hypothetical protein  35.59 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  41.67 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 1040 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 891 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2906  Heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3214  Heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1993  hypothetical protein  27.42 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  35.09 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3072  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.356914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3497  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 1021 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 1021 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 1182 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 1013 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  38.18 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1654  Heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.529157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>