190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0033 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  81.54 
 
 
65 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  80 
 
 
65 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  64.06 
 
 
64 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 
65 aa  80.9  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  60.32 
 
 
79 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  58.06 
 
 
65 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  54.39 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  56.14 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 
67 aa  62  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  50.88 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  50.88 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  54.39 
 
 
65 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  49.12 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  50.88 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  46.97 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  48.39 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  50.85 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  43.86 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  47.54 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 
73 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  46.97 
 
 
68 aa  57  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  56.14 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
77 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  48.33 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 
62 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  38.33 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  50.91 
 
 
70 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  50.91 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
76 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3497  heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
73 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
72 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  46.77 
 
 
70 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  38.46 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  38.46 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  45 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  39.39 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  45.16 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  45.83 
 
 
75 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  38.81 
 
 
68 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
66 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
70 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 
65 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  40.62 
 
 
68 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  36.51 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  39.66 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  35.48 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  36.36 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1892  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799181  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  36.36 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  37.1 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1654  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.529157  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  38.1 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  38.6 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  43.33 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  37.93 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.68 
 
 
473 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  44.26 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0485  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.477053 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>