226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0030 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 64 aa  130  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  57.14 
 
 		 79 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  54.24 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  50.79 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  50.79 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  50.79 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  53.33 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  49.21 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  46.55 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  49.21 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  49.21 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  49.21 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  49.21 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  49.21 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 70 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  39.66 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  41.94 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  47.46 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  47.46 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  44.44 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  43.75 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  37.5 
 
 		 64 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.29 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  45 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  44.29 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  45 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  45 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  45 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  45 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  45 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 894 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  43.33 
 
 		 834 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  43.33 
 
 		 834 aa  50.1  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  43.33 
 
 		 834 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 834 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  43.33 
 
 		 834 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  43.33 
 
 		 834 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  43.33 
 
 		 834 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  43.33 
 
 		 834 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  46.67 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  43.33 
 
 		 834 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  40.68 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  38.98 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  46.55 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  44.29 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  44.29 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  37.93 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 76 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  38.24 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0547  copper exporting ATPase  41.67 
 
 		 833 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  41.67 
 
 		 961 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>