36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0386 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0386  copper-transporter protein CopZ  100 
 
 
68 aa  137  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1545  copper chaperone  55.22 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
833 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  35.94 
 
 
64 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  31.34 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  44.19 
 
 
835 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  36.51 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  30.77 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  27.69 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  28.79 
 
 
732 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  38.71 
 
 
99 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  42.22 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0879  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
762 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.573666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1328  heavy metal-binding domain-containing protein  29.69 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0385321 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  31.67 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  25.76 
 
 
732 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  25.76 
 
 
732 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  25.76 
 
 
732 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  43.18 
 
 
925 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  42.5 
 
 
762 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2002  heavy metal-binding domain-containing protein  29.69 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.288173  normal  0.289179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  27.27 
 
 
732 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  43.9 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  27.27 
 
 
732 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  27.27 
 
 
732 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  27.27 
 
 
732 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  27.27 
 
 
732 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  27.27 
 
 
732 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  27.27 
 
 
732 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  27.27 
 
 
732 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  25.76 
 
 
732 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 
108 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>