39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2002 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2002  heavy metal-binding domain-containing protein  100 
 
 		 67 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.288173  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1328  heavy metal-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0385321 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2375  heavy metal-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00029773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 816 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  32.81 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 813 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  41.27 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  38.46 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  38.71 
 
 		 817 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  37.7 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 755 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 748 aa  42.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 804 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 1071 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  32.26 
 
 		 69 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 838 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 852 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 799 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  38.24 
 
 		 751 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  32.86 
 
 		 824 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 		 835 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  29.23 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  31.15 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 832 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 840 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0876  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 750 aa  40.8  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0386  copper-transporter protein CopZ  29.69 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1003  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 807 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 73 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  38.98 
 
 		 833 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  32.26 
 
 		 66 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 66 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>