276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4238 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 68 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  91.18 
 
 		 68 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  62.12 
 
 		 68 aa  84.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  58.21 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  56.06 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  60.61 
 
 		 68 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  59.42 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  54.55 
 
 		 69 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  53.03 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  53.03 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 68 aa  73.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  53.73 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  55.07 
 
 		 73 aa  72.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 		 69 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 69 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 		 76 aa  70.1  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  53.12 
 
 		 69 aa  70.1  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 		 67 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  57.81 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  61.19 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  58.21 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  54.39 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  46.97 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  52.11 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  54.24 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 		 73 aa  62  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 		 76 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  55 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  43.66 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  48 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  53.33 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  46.03 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  51.56 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  41.94 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  48.44 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  51.56 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  43.75 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  41.54 
 
 		 68 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  47.37 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  40.91 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  33.82 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  40 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1877  heavy metal transport/detoxification protein  32.84 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.186242  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 762 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 839 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 762 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  42.62 
 
 		 954 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  33.85 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  33.85 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 762 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 767 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  40.98 
 
 		 1196 aa  48.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 913 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  54.35 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 835 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  44.26 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 803 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  42.65 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 856 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  31.82 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  34.92 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 762 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>