22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1328 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1328  heavy metal-binding domain-containing protein  100 
 
 		 69 aa  139  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0385321 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2002  heavy metal-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 67 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.288173  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2375  heavy metal-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00029773  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 755 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  32.81 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 976 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 861 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  34.43 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 813 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  38.81 
 
 		 751 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  38.1 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 816 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0386  copper-transporter protein CopZ  29.69 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1742  cadmium-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 773 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.106711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0802  heavy metal translocating P-type ATPase  31.75 
 
 		 725 aa  40  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>