More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3224 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  45.31 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  46.15 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  44.26 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  49.15 
 
 		 894 aa  57.8  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 65 aa  57  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  43.75 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 976 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  44.44 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  38.71 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  46.03 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 839 aa  54.3  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  40 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  41.94 
 
 		 817 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  42.86 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2375  heavy metal-binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00029773  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 833 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  39.06 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  50.91 
 
 		 68 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0963  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  40.62 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  49.25 
 
 		 72 aa  52.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 856 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  51.85 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  41.54 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  42.37 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  45 
 
 		 826 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  38.24 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 827 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 799 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06720  copper chaperone  40 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00676012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  40.68 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 799 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  36.36 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  43.64 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 1182 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  34.38 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 800 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 841 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 68 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  39.06 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  40.68 
 
 		 792 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 833 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  38.1 
 
 		 751 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 913 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  38.98 
 
 		 792 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 797 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>