161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06720 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06720  copper chaperone  100 
 
 		 131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00676012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0963  Heavy metal transport/detoxification protein  36.61 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  39.06 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  40.32 
 
 		 810 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0090  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 764 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 891 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  47.76 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 		 839 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 804 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36160  copper/silver-translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 847 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 1182 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3699  heavy metal-transporting ATPase  31.82 
 
 		 745 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0922687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0020  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 		 746 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.668167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10093  cation transporter ATPase A ctpA  33.33 
 
 		 761 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19800  copper/silver-translocating P-type ATPase  30.16 
 
 		 768 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 833 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  38.71 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 867 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  37.08 
 
 		 907 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0081  heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 		 751 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.768822  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5747  heavy metal translocating P-type ATPase  31.67 
 
 		 792 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  35.06 
 
 		 1013 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 833 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3259  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 884 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48196  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  34.29 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 730 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  36.36 
 
 		 819 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4018  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 777 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  28.41 
 
 		 1040 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  37.7 
 
 		 907 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 785 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646139  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 841 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  45.9 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  28.41 
 
 		 819 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 816 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 1021 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 1021 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5704  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 782 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.563796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 782 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5305  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 782 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.585321  normal  0.36068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4240  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 		 785 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 841 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3605  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 765 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 894 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36740  copper/silver-translocating P-type ATPase  31.67 
 
 		 769 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  33.9 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 228 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 778 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  31.67 
 
 		 737 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  31.67 
 
 		 737 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10104  cation transporter ATPase B ctpB  36.07 
 
 		 752 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 856 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1452  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 760 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1470  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 760 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5837  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 733 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3873  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 770 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  31.75 
 
 		 785 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 835 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2501  heavy metal translocating P-type ATPase  38.36 
 
 		 810 aa  43.5  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.792891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 827 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  32.31 
 
 		 955 aa  43.5  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.057349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  32.31 
 
 		 961 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 859 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  36.49 
 
 		 745 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0013  heavy metal translocating P-type ATPase  31.67 
 
 		 745 aa  42.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 829 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  40 
 
 		 834 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 834 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2848  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  31.67 
 
 		 752 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 		 971 aa  42  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  39.66 
 
 		 742 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 757 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3074  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 		 845 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  40 
 
 		 834 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 839 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  40 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  40 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  40 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  39.06 
 
 		 826 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>