More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36160 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4240  heavy metal translocating P-type ATPase  58.73 
 
 
785 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5305  heavy metal translocating P-type ATPase  61.04 
 
 
782 aa  702    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.585321  normal  0.36068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5837  heavy metal translocating P-type ATPase  52.47 
 
 
733 aa  696    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  53 
 
 
750 aa  687    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36740  copper/silver-translocating P-type ATPase  57 
 
 
769 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2848  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  56.21 
 
 
752 aa  667    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8844  heavy metal translocating P-type ATPase  54.27 
 
 
764 aa  676    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0781  heavy metal translocating P-type ATPase  54.68 
 
 
773 aa  693    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114633  decreased coverage  0.000689318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  58.59 
 
 
785 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3699  heavy metal-transporting ATPase  56.35 
 
 
745 aa  717    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0922687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0013  heavy metal translocating P-type ATPase  54.46 
 
 
745 aa  712    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0020  heavy metal-transporting ATPase  55.14 
 
 
746 aa  752    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.668167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  56.11 
 
 
769 aa  761    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  55.49 
 
 
766 aa  746    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  61.23 
 
 
867 aa  715    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  59.97 
 
 
850 aa  691    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.888341  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  54.36 
 
 
757 aa  744    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1901  heavy metal translocating P-type ATPase  54.17 
 
 
749 aa  694    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1679  heavy metal translocating P-type ATPase  55.94 
 
 
810 aa  673    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238517  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3605  heavy metal translocating P-type ATPase  62.34 
 
 
765 aa  699    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5747  heavy metal translocating P-type ATPase  55.28 
 
 
792 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6538  heavy metal translocating P-type ATPase  55.8 
 
 
785 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451318  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36160  copper/silver-translocating P-type ATPase  100 
 
 
847 aa  1644    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735078  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  51.19 
 
 
819 aa  691    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  70.09 
 
 
868 aa  962    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1452  heavy metal translocating P-type ATPase  55.56 
 
 
760 aa  728    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  60.93 
 
 
737 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  55.25 
 
 
762 aa  685    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4018  heavy metal translocating P-type ATPase  55.29 
 
 
777 aa  687    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  57.37 
 
 
760 aa  757    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.879703  decreased coverage  0.00498444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4550  heavy metal translocating P-type ATPase  55.13 
 
 
761 aa  746    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  60.93 
 
 
737 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  55.01 
 
 
758 aa  696    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4099  heavy metal translocating P-type ATPase  53.85 
 
 
779 aa  719    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3259  heavy metal translocating P-type ATPase  57.92 
 
 
884 aa  803    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.48196  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3873  heavy metal translocating P-type ATPase  53.87 
 
 
770 aa  665    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658121 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2501  heavy metal translocating P-type ATPase  67.42 
 
 
810 aa  983    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.792891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  55.95 
 
 
785 aa  734    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5704  heavy metal translocating P-type ATPase  61.04 
 
 
782 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.563796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1470  heavy metal translocating P-type ATPase  55.56 
 
 
760 aa  728    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  60.93 
 
 
737 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  60.31 
 
 
782 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  53.92 
 
 
737 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  56.28 
 
 
755 aa  756    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0448  heavy metal translocating P-type ATPase  61.69 
 
 
763 aa  635  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189205  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  52.66 
 
 
737 aa  630  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0090  heavy metal translocating P-type ATPase  61.17 
 
 
764 aa  627  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0536  heavy metal translocating P-type ATPase  60.4 
 
 
764 aa  609  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188836  normal  0.0794142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6798  heavy metal translocating P-type ATPase  51.87 
 
 
739 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2769  heavy metal translocating P-type ATPase  47.59 
 
 
739 aa  575  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0304144  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10093  cation transporter ATPase A ctpA  45.4 
 
 
761 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10104  cation transporter ATPase B ctpB  44.75 
 
 
752 aa  550  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  39.36 
 
 
805 aa  548  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.3 
 
 
794 aa  542  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  38.14 
 
 
743 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2618  heavy metal translocating P-type ATPase  41.74 
 
 
754 aa  534  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  37.9 
 
 
802 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  37.9 
 
 
802 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  37.78 
 
 
815 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  39.93 
 
 
753 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  39.5 
 
 
797 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  39.52 
 
 
806 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  39.06 
 
 
805 aa  524  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  38.31 
 
 
798 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  39.17 
 
 
805 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
806 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  39.06 
 
 
805 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  39.06 
 
 
805 aa  522  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  38.71 
 
 
805 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  39.06 
 
 
805 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  39.4 
 
 
806 aa  522  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  49.32 
 
 
792 aa  522  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  40.16 
 
 
786 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  37.22 
 
 
797 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  39.01 
 
 
750 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  38.42 
 
 
803 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  38.86 
 
 
799 aa  503  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  39.75 
 
 
837 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  40.67 
 
 
849 aa  500  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  39.77 
 
 
826 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  38.11 
 
 
821 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  39.43 
 
 
752 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  37.35 
 
 
798 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  40.96 
 
 
836 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  41.8 
 
 
817 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  37.35 
 
 
798 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  36.19 
 
 
818 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  41.66 
 
 
822 aa  490  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
889 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  44.33 
 
 
824 aa  489  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  38.69 
 
 
837 aa  486  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  39.86 
 
 
831 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 
811 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  39.67 
 
 
905 aa  486  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  37.63 
 
 
759 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  40.82 
 
 
811 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  34.6 
 
 
889 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  40.77 
 
 
839 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  36.53 
 
 
759 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  38.47 
 
 
838 aa  483  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>