230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3258 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
160 aa  314  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  56.38 
 
 
117 aa  101  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  54.17 
 
 
100 aa  100  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  70.83 
 
 
132 aa  98.6  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  55.07 
 
 
73 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  55 
 
 
73 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  56.06 
 
 
76 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  52.17 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 
76 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  52.94 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  58.06 
 
 
80 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  58.06 
 
 
80 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  51.52 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  47.83 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  49.25 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 
77 aa  61.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 
78 aa  61.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 
73 aa  61.2  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  47.76 
 
 
68 aa  60.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 
69 aa  60.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 
69 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  45.45 
 
 
67 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 
65 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  48.53 
 
 
69 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 
67 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  49.3 
 
 
69 aa  58.9  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  45.07 
 
 
71 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  49.3 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
68 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  48.48 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  53.62 
 
 
72 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  46.27 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  49.25 
 
 
67 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
976 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  49.23 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  45.45 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  49.23 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  38.81 
 
 
67 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  38.81 
 
 
67 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  34.33 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  42.65 
 
 
69 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
68 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
835 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  42.03 
 
 
70 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  43.48 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  42.47 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
833 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
76 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
839 aa  51.6  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 
68 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  42.42 
 
 
66 aa  51.2  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  34.92 
 
 
68 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
79 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  48.48 
 
 
75 aa  50.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  40 
 
 
71 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
739 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  39.39 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  47.69 
 
 
832 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
804 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  46.15 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  39.13 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  52.86 
 
 
67 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  47.69 
 
 
832 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  43.48 
 
 
71 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  41.94 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  40.91 
 
 
68 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  40.91 
 
 
68 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 
859 aa  48.5  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 
68 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  30.61 
 
 
894 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
63 aa  48.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
63 aa  48.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
833 aa  48.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
841 aa  48.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
65 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  38.81 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
836 aa  48.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
867 aa  47.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
852 aa  47.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
67 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 
70 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
67 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
67 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  42.25 
 
 
70 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
827 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
925 aa  47  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
855 aa  47.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
68 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  50.91 
 
 
72 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
730 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>