200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0489 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 74 aa  143  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  60.94 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  62.5 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  56.06 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  58.46 
 
 		 68 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 		 69 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  56.45 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  55.38 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  59.68 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  58.46 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  59.38 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  52.05 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  59.09 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  53.52 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  53.42 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  57.89 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  49.35 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 73 aa  57  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  49.23 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  55.38 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  50.77 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  50.77 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  50.79 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  44.07 
 
 		 976 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  47.06 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  50.82 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  48.39 
 
 		 824 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  50.79 
 
 		 832 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  44.12 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 		 832 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  45.95 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 		 814 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  45.95 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  45.95 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  42.37 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  49.21 
 
 		 830 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  44.93 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 827 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 839 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  39.39 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  39.39 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  45.31 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  43.48 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 739 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 		 839 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 826 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  37.88 
 
 		 792 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  40.68 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1545  copper chaperone  37.5 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  37.5 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  51.47 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  39.39 
 
 		 792 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  37.31 
 
 		 826 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2514  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 845 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>