147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4020 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
76 aa  149  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  62.12 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  60.87 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  60.29 
 
 
70 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  60.29 
 
 
70 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  58.57 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  60.61 
 
 
70 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  61.76 
 
 
71 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  58.82 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  58.82 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 
66 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 
78 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  51.56 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  53.12 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 
68 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 
68 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 
73 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  47.69 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 
70 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  50.82 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  54.84 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  48.39 
 
 
93 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  48.44 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  45.83 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 
69 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
71 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
77 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  53.06 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  43.94 
 
 
891 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  40.58 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2989  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  40 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  41.18 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
64 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
80 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
80 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
835 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  40.91 
 
 
67 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.29 
 
 
473 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  43.66 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  43.66 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  36.76 
 
 
228 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2844  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  40.85 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  30.77 
 
 
1196 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  34.85 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.94 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  39.13 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  32.35 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  37.7 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  32.35 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  32.35 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  32.35 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  32.35 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  34.29 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  32.35 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
799 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  39.68 
 
 
76 aa  42.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  37.5 
 
 
817 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23420  hypothetical protein  45.83 
 
 
49 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0366798  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
800 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  40.3 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  32.86 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
799 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  32.81 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  32.86 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  34.78 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
856 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  34.78 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>