90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5705 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
80 aa  157  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
80 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  90 
 
 
80 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  63.38 
 
 
72 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  56.41 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  53.25 
 
 
76 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 
76 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  54.79 
 
 
73 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  58.57 
 
 
74 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  57.58 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  51.43 
 
 
73 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  52.86 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 
73 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  54.69 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  50.68 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  61.54 
 
 
72 aa  64.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  50.7 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
68 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  54.29 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  48.57 
 
 
69 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  48.68 
 
 
68 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  54.29 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  48.65 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  50 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  47.14 
 
 
100 aa  59.3  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  46.03 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  47.83 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  48 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
77 aa  57.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  48.48 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  48.48 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  46.67 
 
 
93 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
70 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  41.43 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 
69 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 
68 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  49.02 
 
 
75 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  53.06 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  45.71 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  40.62 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  46.15 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  55.1 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  41.54 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  45.95 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  51.06 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.08 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  33.78 
 
 
755 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.26 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  37.68 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  44.26 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  36.51 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
83 aa  42.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  36.92 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  40.28 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  42.86 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  42.62 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 
859 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1545  copper chaperone  51.43 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  34.38 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  52.78 
 
 
68 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 
814 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  36.92 
 
 
69 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  40.62 
 
 
79 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  38.33 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  40.98 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  32.31 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  40.98 
 
 
69 aa  40.4  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  52.63 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  36.67 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>