More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5882 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
69 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  65.67 
 
 
69 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  64.62 
 
 
71 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  59.42 
 
 
69 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  60.61 
 
 
68 aa  80.5  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  59.09 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 
73 aa  77  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  63.64 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  54.41 
 
 
68 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  60.87 
 
 
69 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  59.68 
 
 
77 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  58.46 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  53.73 
 
 
70 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 
68 aa  72  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  54.41 
 
 
68 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 
73 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  61.02 
 
 
74 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  58.82 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  47.76 
 
 
68 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 
70 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 
65 aa  68.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 
76 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  58.73 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 
70 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  53.03 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  53.62 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  51.52 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  53.97 
 
 
71 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  57.89 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  53.12 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  48.57 
 
 
73 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  47.14 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  51.43 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  59.68 
 
 
74 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  46.27 
 
 
69 aa  60.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 
65 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  47.76 
 
 
100 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  57.58 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  61.82 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  43.08 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  48.53 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  48.53 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  50 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  41.27 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  52.78 
 
 
72 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  43.94 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1545  copper chaperone  43.08 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
859 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  41.79 
 
 
71 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  49.15 
 
 
79 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
925 aa  53.5  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  42.65 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0963  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
130 aa  52.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032314  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 
839 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  36.92 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2097  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.712519 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  47.69 
 
 
109 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 
65 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
833 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
839 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
69 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  37.31 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
852 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  43.94 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
97 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  46.55 
 
 
894 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  43.94 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  42.03 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0162  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 
228 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.988191  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
762 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  46.15 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  38.03 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  38.33 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>