More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0674 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 68 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  67.69 
 
 		 68 aa  84.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  68.42 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  67.74 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  60.66 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 68 aa  73.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  61.29 
 
 		 69 aa  73.6  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  58.73 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 		 69 aa  70.5  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  63.93 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  52.17 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  54.55 
 
 		 73 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  58.73 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  56.45 
 
 		 71 aa  67  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  51.61 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  55.56 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  54.84 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  57.58 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  51.61 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  51.61 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  58.33 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  53.23 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  55.56 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  56.45 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  54.24 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  59.09 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  60 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  59.09 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  44.62 
 
 		 954 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  51.61 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  43.75 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  38.98 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 726 aa  50.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 196 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  42.65 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 720 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  34.92 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 789 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 1087 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  40.68 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  42.25 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  40.32 
 
 		 732 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  40.32 
 
 		 732 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  40.32 
 
 		 732 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  36.92 
 
 		 817 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0659  heavy metal-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  34.92 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  37.88 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  40.32 
 
 		 732 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  40.32 
 
 		 732 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 913 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 833 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  40.98 
 
 		 91 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  40.98 
 
 		 91 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>