More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1715 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  100 
 
 		 77 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  63.77 
 
 		 70 aa  88.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  60 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  47.83 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  47.83 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  45.07 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  58.33 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  58.33 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  58.33 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  58.33 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  58.33 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  56.67 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  56.67 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  56.67 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  48.39 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  56.67 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  49.18 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  47.06 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  50 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  45.31 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  46.67 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 887 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  43.55 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  45 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  43.33 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  41.67 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 836 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 		 758 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  39.71 
 
 		 890 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  53.33 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  53.33 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  53.33 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 820 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  49.23 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  34.38 
 
 		 833 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  42.19 
 
 		 1196 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 837 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  45 
 
 		 942 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 838 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 814 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  46.77 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  42.86 
 
 		 954 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  48.39 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  38.81 
 
 		 751 aa  54.3  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 861 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  49.15 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 871 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  48.39 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 839 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  43.33 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  39.71 
 
 		 742 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2990  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 756 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 889 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 889 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 754 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  40.3 
 
 		 826 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 		 827 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  34.25 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 71 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  42.62 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  32.88 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.67 
 
 		 818 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2195  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 		 756 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  48.33 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  41.67 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 894 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  43.28 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 868 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  44.26 
 
 		 79 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 836 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 802 aa  52.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 1071 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  32 
 
 		 885 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 837 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2277  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.938593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 		 976 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 826 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 1087 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  40 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 851 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1925  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 838 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.715176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 824 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  32.88 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  40.58 
 
 		 789 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  41.38 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 1040 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 835 aa  50.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  34.33 
 
 		 799 aa  50.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  28.38 
 
 		 806 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>