More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3349 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  130  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  77.97 
 
 		 70 aa  93.6  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  77.97 
 
 		 70 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  60.61 
 
 		 66 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  67.74 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  56.06 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  57.14 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  43.08 
 
 		 78 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  51.67 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  43.55 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  47.14 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  54.1 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  53.33 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  53.33 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  45.31 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  45.31 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  44.29 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  43.33 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 64 aa  57  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  46.88 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  48.33 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  48.33 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  41.94 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  42.86 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  45.31 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  45.59 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  42.19 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  43.86 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  37.1 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4089  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  36.92 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 		 64 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  38.46 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3404  hypothetical protein  35 
 
 		 77 aa  50.8  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 833 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  40.62 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  40 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 835 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  40.62 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  40.62 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1654  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.529157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  40.62 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  38.03 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  40.62 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  40.62 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>