94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3787 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3787  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 72 aa  139  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  64.79 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  65.67 
 
 		 80 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  65.67 
 
 		 80 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  67.21 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  62.12 
 
 		 73 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  56.72 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  56.34 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  58.33 
 
 		 76 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  57.38 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  56.52 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  57.38 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  55.07 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 68 aa  62  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  57.63 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  51.47 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  51.67 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  46.88 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  49.15 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  49.18 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  48.61 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  58.7 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  47.06 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  52.46 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  61.11 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  47.62 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  49.23 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  49.18 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  45.45 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  48 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  46.97 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  43.06 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  44.26 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  63.64 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  39.13 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  50.85 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  57.14 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  52.5 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  39.34 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  43.08 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  38.98 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0963  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1312  mercuric transport protein periplasmic component  33.93 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  49.12 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  48.44 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  44.26 
 
 		 68 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  44.26 
 
 		 67 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  45.31 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1877  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 67 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.186242  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  37.7 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  46.51 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  51.35 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  57.14 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  35 
 
 		 70 aa  41.2  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  34.21 
 
 		 835 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  32.26 
 
 		 1196 aa  40.4  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  37.7 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  40.98 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  47.37 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 69 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 62 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  36.07 
 
 		 65 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>