144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1787 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  43.08 
 
 		 66 aa  67  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  46.03 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  42.37 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  36.51 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  42.59 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0394  hypothetical protein  36.51 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0593872  hitchhiker  1.762e-17 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  42.59 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  36.51 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  44.07 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  36.51 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0386  hypothetical protein  34.92 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000012087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  42.62 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  38.24 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  44.07 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  38.33 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  36.67 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3497  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2245  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4050  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  41.43 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  36.23 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  40.68 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  40.68 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  37.7 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 891 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 829 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3692  hypothetical protein  37.65 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3404  hypothetical protein  32.35 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  36.11 
 
 		 1061 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  36.11 
 
 		 1061 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  34.92 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  36.11 
 
 		 1061 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  36.11 
 
 		 1063 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  36.11 
 
 		 1061 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  36.11 
 
 		 1063 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4099  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 779 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  40 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 799 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  34.48 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3228  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  40 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 799 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  33.9 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 799 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 971 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  30.51 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 1021 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>