123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1951 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  100 
 
 		 81 aa  169  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  43.59 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  41.18 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  43.55 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1368  heavy metal transport/detoxification protein  45.12 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2891  putative copper chaperone  35.94 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1537  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.330529  normal  0.80617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2983  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  32.89 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2298  heavy metal binding protein  42.11 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775162  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  38.33 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3009  heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6074  Heavy metal transport/detoxification protein  42.11 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0961744  normal  0.102 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6338  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3036  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  34.92 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  43.33 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2375  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2989  heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2899  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  38.89 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1654  Heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.529157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  38.89 
 
 		 70 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0117  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295376 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1877  heavy metal transport/detoxification protein  39.58 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.186242  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3241  heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2321  hypothetical protein  38.1 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  40 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3404  hypothetical protein  29.69 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2531  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5393  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0029  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.787657  decreased coverage  0.0000308968 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06045  superoxide dismutase copper chaperone Lys7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09700)  33.78 
 
 		 247 aa  47.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4415  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1406  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  35 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  32.81 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  34.38 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  32.81 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1834  heavy metal transport/detoxification protein  43.18 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  34.38 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0030  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.962189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0028  heavy metal transport/detoxification protein  36.07 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1106  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0639818  normal  0.0373114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0282  heavy metal-binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18800  hypothetical protein  28.33 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0113  Heavy metal transport/detoxification protein  38.1 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612125  normal  0.480924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  31.25 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0225  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0504  putative cheavy metal binding protein  32.79 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3036  heavy metal-binding domain-containing protein  32.79 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.71925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2056  heavy metal-binding domain-containing protein  32.79 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0309  heavy metal-binding domain-containing protein  32.79 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0322  heavy metal-binding domain-containing protein  32.79 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2228  heavy metal-binding domain-containing protein  32.79 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0643  hypothetical protein  35.59 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  31.25 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90546  copper chaperone involved in lysine biosynthesis and oxidative stress protection  29.33 
 
 		 248 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.91221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  33.87 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1627  hypothetical protein  25 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  32.81 
 
 		 67 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  31.25 
 
 		 65 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  33.85 
 
 		 109 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 68 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  26.98 
 
 		 75 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  32.2 
 
 		 64 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2906  Heavy metal transport/detoxification protein  31.15 
 
 		 65 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3214  Heavy metal transport/detoxification protein  31.15 
 
 		 65 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  32.81 
 
 		 67 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>